Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbf1Q6DFZ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbf1Q6DFZ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbf1Q6DFZ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbf1Q6DFZ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms