Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CilpQ66K08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CilpQ66K08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CilpQ66K08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms