Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpgs2Q66JT5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpgs2Q66JT5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpgs2Q66JT5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpgs2Q66JT5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms