Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccpg1Q640L3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccpg1Q640L3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccpg1Q640L3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccpg1Q640L3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccpg1Q640L3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms