Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CochQ62507 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CochQ62507 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CochQ62507 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CochQ62507 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CochQ62507 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CochQ62507 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CochQ62507 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CochQ62507 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CochQ62507 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CochQ62507 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CochQ62507 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CochQ62507 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CochQ62507 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CochQ62507 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CochQ62507 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CochQ62507 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CochQ62507 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CochQ62507 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CochQ62507 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CochQ62507 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CochQ62507 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CochQ62507 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CochQ62507 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CochQ62507 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CochQ62507 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CochQ62507 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CochQ62507 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CochQ62507 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CochQ62507 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CochQ62507 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CochQ62507 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CochQ62507 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CochQ62507 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CochQ62507 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CochQ62507 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CochQ62507 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CochQ62507 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CochQ62507 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CochQ62507 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CochQ62507 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CochQ62507 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CochQ62507 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CochQ62507 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CochQ62507 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CochQ62507 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CochQ62507 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CochQ62507 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CochQ62507 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CochQ62507 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CochQ62507 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CochQ62507 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CochQ62507 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CochQ62507 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CochQ62507 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CochQ62507 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CochQ62507 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CochQ62507 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CochQ62507 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CochQ62507 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CochQ62507 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CochQ62507 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CochQ62507 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CochQ62507 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CochQ62507 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CochQ62507 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CochQ62507 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CochQ62507 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CochQ62507 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CochQ62507 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CochQ62507 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CochQ62507 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CochQ62507 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CochQ62507 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CochQ62507 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CochQ62507 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CochQ62507 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CochQ62507 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CochQ62507 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CochQ62507 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CochQ62507 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CochQ62507 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CochQ62507 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CochQ62507 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CochQ62507 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CochQ62507 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CochQ62507 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CochQ62507 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CochQ62507 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CochQ62507 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CochQ62507 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms