Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TrhQ62361 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TrhQ62361 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TrhQ62361 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TrhQ62361 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TrhQ62361 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TrhQ62361 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TrhQ62361 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TrhQ62361 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TrhQ62361 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TrhQ62361 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TrhQ62361 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TrhQ62361 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TrhQ62361 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TrhQ62361 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TrhQ62361 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TrhQ62361 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TrhQ62361 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms