Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim21Q62191 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim21Q62191 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim21Q62191 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim21Q62191 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim21Q62191 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms