Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC22,2■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22,17■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Prm3Q62100 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22,11■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22,08■■□□□ 1,13
Prm3Q62100 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Prm3Q62100 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,8 ms