Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf1Q61999 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf1Q61999 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms