Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gata6Q61169 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gata6Q61169 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gata6Q61169 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gata6Q61169 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gata6Q61169 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gata6Q61169 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gata6Q61169 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gata6Q61169 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gata6Q61169 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gata6Q61169 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gata6Q61169 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms