Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms