Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik1Q60934 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik1Q60934 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik1Q60934 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Grik1Q60934 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms