Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atf3Q60765 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atf3Q60765 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Atf3Q60765 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Atf3Q60765 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Atf3Q60765 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Atf3Q60765 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Atf3Q60765 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atf3Q60765 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atf3Q60765 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atf3Q60765 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atf3Q60765 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Atf3Q60765 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atf3Q60765 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Atf3Q60765 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atf3Q60765 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Atf3Q60765 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atf3Q60765 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atf3Q60765 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms