Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P4ha1Q60715 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
P4ha1Q60715 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
P4ha1Q60715 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
P4ha1Q60715 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
P4ha1Q60715 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms