Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp13a3Q5XF89 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp13a3Q5XF89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp13a3Q5XF89 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp13a3Q5XF89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp13a3Q5XF89 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms