Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uimc1Q5U5Q9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uimc1Q5U5Q9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uimc1Q5U5Q9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uimc1Q5U5Q9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Uimc1Q5U5Q9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Uimc1Q5U5Q9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms