Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med13Q5SWW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med13Q5SWW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med13Q5SWW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med13Q5SWW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms