Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SynrgQ5SV85 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SynrgQ5SV85 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynrgQ5SV85 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynrgQ5SV85 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SynrgQ5SV85 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SynrgQ5SV85 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms