Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sco1Q5SUC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sco1Q5SUC9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sco1Q5SUC9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sco1Q5SUC9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms