Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zdbf2Q5SS00 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zdbf2Q5SS00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zdbf2Q5SS00 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zdbf2Q5SS00 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zdbf2Q5SS00 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zdbf2Q5SS00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms