Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPV6

Uncharacterized protein C2orf73 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5SPV6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q5SPV6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q5SPV6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q5SPV6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q5SPV6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5SPV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5SPV6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5SPV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5SPV6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5SPV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5SPV6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5SPV6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5SPV6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5SPV6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5SPV6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5SPV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5SPV6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5SPV6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q5SPV6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5SPV6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q5SPV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q5SPV6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms