Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col27a1Q5QNQ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col27a1Q5QNQ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col27a1Q5QNQ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col27a1Q5QNQ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col27a1Q5QNQ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms