Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam208bQ5DTT3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam208bQ5DTT3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam208bQ5DTT3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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