Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1nQ497L1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2al1nQ497L1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms