Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810049J17RikQ3V2G9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810049J17RikQ3V2G9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1810049J17RikQ3V2G9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1810049J17RikQ3V2G9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810049J17RikQ3V2G9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms