Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc9Q3V038 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc9Q3V038 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc9Q3V038 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc9Q3V038 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc9Q3V038 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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