Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed1Q3V009 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed1Q3V009 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmed1Q3V009 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed1Q3V009 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms