Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrfip1Q3UZ39 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrrfip1Q3UZ39 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrfip1Q3UZ39 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrfip1Q3UZ39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrfip1Q3UZ39 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms