Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Garem1Q3UFT3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Garem1Q3UFT3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Garem1Q3UFT3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Garem1Q3UFT3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Garem1Q3UFT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.9 ms