Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Yipf3Q3UDR8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Yipf3Q3UDR8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Yipf3Q3UDR8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Yipf3Q3UDR8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms