Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim6Q3U0I6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim6Q3U0I6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim6Q3U0I6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim6Q3U0I6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim6Q3U0I6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms