Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdpd4Q3TT99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdpd4Q3TT99 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdpd4Q3TT99 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gdpd4Q3TT99 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdpd4Q3TT99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdpd4Q3TT99 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gdpd4Q3TT99 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms