Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Smarca4Q3TKT4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Smarca4Q3TKT4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Smarca4Q3TKT4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Smarca4Q3TKT4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Smarca4Q3TKT4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Smarca4Q3TKT4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Smarca4Q3TKT4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Smarca4Q3TKT4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Smarca4Q3TKT4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Smarca4Q3TKT4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Smarca4Q3TKT4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC41.88■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC41.88■■■■■ 4.3
Smarca4Q3TKT4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Smarca4Q3TKT4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Smarca4Q3TKT4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Smarca4Q3TKT4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Smarca4Q3TKT4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Smarca4Q3TKT4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Smarca4Q3TKT4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Smarca4Q3TKT4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Smarca4Q3TKT4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Smarca4Q3TKT4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Smarca4Q3TKT4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms