Protein–RNA interactions for Protein: Q3TFD2

Lpcat1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat1Q3TFD2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lpcat1Q3TFD2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lpcat1Q3TFD2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lpcat1Q3TFD2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpcat1Q3TFD2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lpcat1Q3TFD2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lpcat1Q3TFD2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms