Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc69Q3TCJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc69Q3TCJ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc69Q3TCJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms