Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd8Q3TA59 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd8Q3TA59 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jmjd8Q3TA59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jmjd8Q3TA59 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms