Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cers3Q1A3B0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cers3Q1A3B0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cers3Q1A3B0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cers3Q1A3B0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cers3Q1A3B0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms