Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lemd1Q14C37 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lemd1Q14C37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lemd1Q14C37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lemd1Q14C37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lemd1Q14C37 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lemd1Q14C37 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lemd1Q14C37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lemd1Q14C37 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms