Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VgfQ0VGU4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VgfQ0VGU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VgfQ0VGU4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VgfQ0VGU4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VgfQ0VGU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms