Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtel1Q0VGM9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtel1Q0VGM9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtel1Q0VGM9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtel1Q0VGM9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtel1Q0VGM9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms