Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hif3aQ0VBL6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hif3aQ0VBL6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif3aQ0VBL6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hif3aQ0VBL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hif3aQ0VBL6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms