Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab42Q0PD08 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab42Q0PD08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab42Q0PD08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab42Q0PD08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms