Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrioQ0KL02 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrioQ0KL02 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrioQ0KL02 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrioQ0KL02 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrioQ0KL02 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms