Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ubxn2bQ0KL01 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ubxn2bQ0KL01 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ubxn2bQ0KL01 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ubxn2bQ0KL01 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn2bQ0KL01 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn2bQ0KL01 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn2bQ0KL01 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn2bQ0KL01 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms