Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm1Q0GA42 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm1Q0GA42 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm1Q0GA42 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm1Q0GA42 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm1Q0GA42 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm1Q0GA42 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cnnm1Q0GA42 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Cnnm1Q0GA42 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnnm1Q0GA42 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnnm1Q0GA42 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnnm1Q0GA42 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cnnm1Q0GA42 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cnnm1Q0GA42 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms