Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cab39Q06138 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cab39Q06138 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cab39Q06138 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms