Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox9Q04887 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox9Q04887 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sox9Q04887 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox9Q04887 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms