Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp39Q02525 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp39Q02525 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp39Q02525 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp39Q02525 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zfp39Q02525 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp39Q02525 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms