Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GabpaQ00422 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GabpaQ00422 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GabpaQ00422 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GabpaQ00422 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GabpaQ00422 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GabpaQ00422 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GabpaQ00422 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GabpaQ00422 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GabpaQ00422 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms