Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited1P97769 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cited1P97769 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cited1P97769 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cited1P97769 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cited1P97769 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited1P97769 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited1P97769 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited1P97769 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited1P97769 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms